Верно: формировать репутацию предприятия.
Повторяющийся союз и... и использован здесь неверно. Корректно: Формировать облепиховую крону можно в форме и куста, и дерева. А лучше: Формировать крону облепихи можно в форме куста или дерева.
Верно: Новый, 2014 год начался... и Будем формировать бюджет следующего, 2015 года...
Оба способа возможны. Более "канцелярский" вариант - использование отглагольных существительных.
Корректно: мотивация к предмету, к изучению предмета.
Деепричастный оборот обособляется. Слово учатся пишется без мягкого знака.
Семантические отличия есть, Вы можете их определить по толковым словарям (например, на нашем портале есть "Большой толковый словарь русского языка"). Что Вы называете закономерностями в способе употребления?