СИСТЕМНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ \\ си[с’т’]емно-функциональный; системно-функц[ыа]нальный, в беглой речи возможно системно-функц[а]нальный.
ИСТОМНЫЙ \\ в формах с сочетанием м[н’]: истомнее... – исто[м]нее.
СИСТЕМНО-ЯЗЫКОВОЙ \\ си[с’т’]емно-языковой; системно-[ие]зыковой и допуст. системно-[йие]зыковой.