Если договор подписал генеральный директор, то верно: договор, подписанный генеральным директором.
Запятая не нужна.
Нет оснований для использования прописной буквы.
Можно так: подписанный сторонами с помощью электронно-цифровой подписи.
Верно: Аемшей (Аемшой) Геннадием.
Варианты различаются по смыслу. Видимо, правильнее: экземпляр, подписанный (обратите внимание, что нужно поставить запятую).
Правильно слитное написание, если слово невернувшиеся не содержит при себе зависимых слов или противопоставления.