Возможны второй и третий варианты.
Правильно: 2-недельный.
Правильно: 2-недельный отпуск.
В недельный срок и в течение недели - почти синонимичные выражения. В недельный срок = за пять рабочих дней. В течение недели часто может означать "до конца рабочей недели".