Второй вариант лучше. Союз лучше перенести на вторую строку.
Правильно: Федерация бокса России (в том числе в середине предложения).
Доказать можно, сославшись на словари, где зафиксировано именно такое значение этого сочетания.
Следует использовать форму мощностью: Филиал имеет четыре коксовые батареи суммарной производственной мощностью 2,2 млн т/год кокса валового 6% влажности.