Теоретически такие формы образовать можно (вакуумы, вакуумов...), но трудно представить себе контекст, в котором они бы понадобились. На практике слово вакуум во множественном числе не употребляется.
Это предложения с пояснительными оборотами, которые отделяются с помощью тире. Оснований для постановки запятых нет.
Корректная пунктуация: Как изменится сила электростатического воздействия двух электрических зарядов, если, не меняя расстояния между ними, перенести их из вакуума в среду...