Второй вариант корректен.
Здесь пишется ни.
Запятая поставлена правильно.
В подобных случаях сказуемое согласуется с ближайшим подлежащим. Союз также пишется слитно. Лучше уточнить: а также рассмотрение (или изучение) системы...
Следует использовать форму единственного числа сказуемого.