Добрый день! Подскажите, как правильно употреблять предлоги: «Иванов А.Е. работает на (или в/во) ФГУП «Атом» с 2012 года».

Подскажите, где пунктуационная ошибка в предложении: " Каждый шестой атом земной коры это атом кремния" ?

Как оформлять внутри одного предложения несколько цитат, представляющих собой законченные предложения, в том числе заканчивающиеся вопросительными и восклицательными знаками? Например: "Вместо того, чтобы спросить "Как ты провёл день, милый?" она всякий раз осыпала его вопросами "Где ты шлялся?", "На что на этот раз ты потратил зарплату?" или "Сколько это будет продолжаться?", срываясь на горестное "И как это у меня хватает сил всё это терпеть!"" Также пример: "Во-первых, предмет изучения учёных непосвящённым кажется очень сложным («Как возникли звёзды?», «Из чего состоит атом?», «Как континенты перемещаются по поверхности твёрдой Земли?»); во вторых..." Меня немного смущают эти запятые после законченных предложений со знаками; также хотелось бы узнать, нужно ли где-нибудь ставить двоеточие перед этими предложениями (цитатами?), и начинать ли их с большой буквы.

Нужно ли ставить тире при указании нового названия объекта в предложениях типа "завод "Машэнерго" (ныне - ООО "Атом")? С уважением Галина