Названия остановок наземного городского общественного транспорта и станций метрополитена заключаются в кавычки. Но пишутся без кавычек названия железнодорожных станций.
Автовокзал – это большая станция пригородного или междугородного автобусного сообщения.
Правильно: Это та самая автобусная остановка.
Да, запятая нужна для отделения деепричастного оборота.
Названия станций метро, остановок наземного городского транспорта заключаются в кавычки (в текстах, но не на картах и схемах и не на самих станциях и остановках).