Эти слова образуют устойчивое сочетание, но не устойчивый оборот со значением сравнения (для оборота не хватает первой части, того, что сравнивается; собственно, нет и значения сравнения).

Запятая не нужна. Ни тот ни другой – устойчивый оборот с повторяющимся союзом, внутри таких конструкций запятая не ставится. Ср.: и день и ночь; и смех и горе; и стар и млад; и так и этак; и там и сям; и туда и сюда.

Устойчивый оборот: тише воды ниже травы.

И день и ночь – устойчивый оборот со значением 'всегда, постоянно', поэтому запятая в нем не ставится. Перестановка слов разрушает фразеологизм, что делает возможным постановку запятой.

Вы правы. Сочетание играть первую скрипку корректно и зафиксировано словарями – как современным «Большим толковым словарем русского языка», так и, например, «Толковым словарем русского языка» под ред. Д. Н. Ушакова (1935–1940).

Рекомендации правильны. В сочетании наверху копен слово наверху является предлогом, исторически образованным слиянием предлога на и формы верху. Быть на верху блаженства – устойчивый оборот, а в устойчивых оборотах часто сохраняются не только ушедшие из языка слова, но и архаичные написания. Ср.: семь пядей во лбу, играть в бирюльки, идти на попятный. Прилагательное попятный вне этого сочетания в современном языке уже не употребляется, и на следовало бы уже писать слитно, однако фразеологизм словно консервирует слова, формы слов и иногда написания.   

Запятая нужна.

Правильно: лекарственно-устойчивый.

Устойчивый оборот иметься в виду пишется в три слова. См. словарную фиксацию. Обратите внимание на ошибку в окончании, правильно: при составлении запроса.

Внутренняя кухня - плеоназм (лексически избыточное сочетание), но при этом довольно устойчивый.