Верно: В отчетный период контролировалось исполнение...
Если определение стоит после счетного оборота (два, три, четыре + существительное), то чаще оно ставится в форме им. падежа мн. числа: за отчетный год и два года, предшествующие…
Правильно: в месяце, следующем за отчетным (но: месяцем, следующим за отчетным).
Такое употребление некорректно, предложение следует перестроить. Возможный вариант: Разработаны отчеты и отчетные формы – всего 51 документ.
Корректно: Следует представлять отчет ежемесячно – 1-го числа месяца, следующего за отчетным.
Надо выделить запятыми определительный оборот, стоящий после определяемого слова: Не позднее 15 числа месяца, следующего за отчетным кварталом, составляет и сдает квартальные отчеты по всем инвестиционным компаниям.
Оборот в связи с этим обособлять не нужно. Если второе полугодие 2016 г. – это и есть отчетный период, то лучше так: В связи с этим ввод данных в ГАС Управление за следующий отчетный период (2-е полугодие 2016 г.) станет доступен с 01.01.2017.