Летальный – приводящий к смерти, летательный – связанный с полетом, предназначенный для полета. Но сочетание обоих прилагательных со словом оружие будет неудачным. Летальным обычно бывает исход, а летательным – аппарат.

Корректно: персонаж Fallout, оружие в Fallout.

Если вводное слово стоит в начале обособленного оборота – запятые ставятся перед вводным словом и после всего обособленного оборота. После вводного слова запятая не ставится. Поэтому верно: Похожее оружие, правда "самопальное", применяют боевики в Сирии.

Если смысловой акцент в этом предложении приходится именно на то, что оружие должно быть таким, как у Бэтмена, запятая перед как не нужна.

В этих примерах обороты с как запятыми не выделяются: Он относится к ней как к сестре. Она использует ножницы как оружие. Ты как врач не вызываешь доверия.

Я знаю, что видел где-то город с домами, наполненными шкафами, в которых лежит всякое разное оружие. 

Запятые не ставятся.

Знаки препинания не требуются.