Сочетание имеет под собой цель трудно признать корректным. Лучше сказать так: Цель этой операции – наведение порядка...
Правильно: достичь цели.
Правильно только: достичь поставленной цели.
Такой метод называется историческим или сравнительно-историческим.
Тире стоит верно.
Корректно: иметь цель.
Пунктуация корректна.
Указанная запятая нужна.
Если союз "и" употреблен в присоединительном значении (к тому же, и причем), то запятую следует поставить.
Запятая перед тире нужна, она закрывает придаточное предложение.