Если по условиям контекста после однородных членов предложения требуется постановка запятой, то она ставится, а тире или ставится, или опускается. В данном случае мы рекомендуем поставить запятую с тире. Так читателю будет ясно, что 30 000 студентов учатся во всех четырех комплексах, а не в последнем из перечисленных.
Правильно через дефис: аппаратно-программный.
Верен первый вариант.
Сокращение ГТО пишут без кавычек: комплекс ГТО, нормы ГТО, значок ГТО.
Такой контекст предложить затруднительно.
Верно: учебный план МОУ "Орлинская СОШ".
Предпочтителен второй вариант.