Правильно: Анализ ресурсного обеспечения показал, что как округ в целом, так и мегаполис имели более низкую обеспеченность, чем... См. подобные случаи в параграфе 29 «Полного академического справочника» под ред. В. В. Лопатина (М., 2006 и след.).
Знаки препинания расставлены верно. Об обособлении оборотов с предлогом независимо от читайте в "Справочнике по пунктуации".