Вы написали верно: неизученные и плохо изученные берега.
Слитное написание корректно. Возможно и раздельное написание (если необходимо подчеркнуть отрицание).
Написание зависит от контекста.
Следует писать раздельно: еще не изученный.
Все верно.
Лучше опустить использование: Система оценки недостаточно эффективна.
В значении "недостаточно убедительна" – недостаточно мотивированна (краткое прилагательное).