Правильно с прописной буквы: Транссибирская магистраль.
Разблокировать – двувидовой глагол, т. е. он может употребляться и как глагол совершенного вида, и как глагол несовершенного вида: Магистраль скоро разблокируют – В настоящее время рабочие разблокируют магистраль.
Если это первое слово официального названия чего-либо, верно: Южно-Сибирский (например, Южно-Сибирская магистраль). Иначе верно: южносибирский (например, южносибирская раса).