Оснований для запятой нет, она не нужна.
Правильно: в отчет попадут (=в отчете появятся).
Корректно: сведения по работам, не выполненным в установленные контрактами сроки.
Правильно: согласно контракту.
Правильно: согласно контракту.
Правильно: согласно контракту.
Запятая не нужна.