Тонкий прозрачный пакет для бумаги, имеющий отверстия для подшивания в папку, называется файлом (им. п. - файл), от англ. file — папка, скоросшиватель. Также правомерно использование слова папка-вкладыш.
Это слово фиксируется словарями русского литературного языка без стилистических помет.
Оснований для постановки запятой нет: Главное, в поиске дырок не наткнуться на иголку.