Здесь нужна запятая.
См. «Письмовник».
Верен второй вариант. Первый вариант возможен при передаче на письме разговорной речи.
В слове яблоня перед ня стоит не согласная, а гласная, поэтому в род. п. мн. ч. его основа оканчивается на мягкую согласную.