Да, запятая нужна: И, как в лесу, было неуютно и глухо в этой необжитой комнате.
Оба указанных слова - именные части составных именных сказуемых.
Запятая перед союзом и не ставится, если части сложносочиненного предложения имеют общий второстепенный член ("в кладовке").