Названия агломераций пишутся с большой буквы.
Корректно: Махачкалинско-Каспийская агломерация.
Метрополис (от греч. metrópolis — главный город), 1) крупная городская агломерация, сложившаяся в результате слияния нескольких городов или слияния города с окрестными поселениями (в этом же значении используется и слово мегаполис); 2) центральный город страны или какого-либо крупного подразделения государственной территории.
Правильно: самарско-тольяттинский.