Нет, запятая не нужна.
Возможны оба варианта.
СМС употребляется как существительное женского или среднего рода.
Слово СМС уже фиксируется словарями русского языка. См. ресурс «Проверка слова».
Слово яму можно выделить знаками тире как приложение с уточняющим или пояснительным значением.
Запятые стоят верно.
Верно: с помощью СМС.
Вариантов целых три: заплесневший, заплесневевший и заплесневелый.
...Была подвергнута уничтожению путем зарытия в яму - острый "канцелярит". То же самое можно сказать проще: была уничтожена - зарыта в яму.