Первая часть сложных слов эко... пишется слитно.
Верно слитное написание: этноэкодеревня.
Употребление кавычек корректно.
При использовании родового наименования (при написании организационно-правовой формы) часть наименования, заключенная в кавычки, не склоняется.
Есть словарная фиксация: экО, нескл., с. (сокр.: экстракорпоральное оплодотворение).