как правильно: в соответствии с собственным стандартом или в соответствии со собственным стандартом второй вариант смотрится и читается ужасно, но вроде бы слово с "С" начинается, значит надо "со".
ответ
Верно: с собственным. Об употреблении предлога со см. вопрос 295574.