Верно: над Серпуховом.
Предпочтительно: в окно.
Воспользуйтесь окном «Искать на Грамоте» (следует ввести занятый).
Верно: Вы были заняты.
Здесь возможны разные варианты пунктуации, например:
Трижды всем миром «ура»!
Трижды, всем миром, «ура»!
Трижды – всем миром – «ура»!
Решение принимает автор стихотворения.
Правильно: Я был слишком занят, чтобы обратить внимание.